المعهد الفرنسي بجنوب افريقيا- قسم البحث (IFAS):
تم انشاء قسم البحث بالمعهد الفرنسي بجنوب افريقيا في العام 1995 حيث يركز اعماله البحثية على مجتمعات جنوب افريقيا منذ عصور ما قبل التاريخ وحتى العصر الحديث والمعاصر، وكذلك على الدراسات الحضرية والتحولات الديمقراطية . ويتم تنفيذ تلك الابحاث في المواقع الأتية: جنوب افريقيا، انغولا، بوتسوانا , ليسوتو , ملاوي ,موزنبيق, ناميبيا , جمهوريه الكنغو الديمقراطية ,سوازيلاند, زامبيا وزيمبابوي.

المعهد الفرنسي للبحث في افريقيا – ابادان “نيجيريا” (IFRA):
تم انشاء المعهد في عام ١٩٩٠ في نيجيريا. تركزت ابحاثه على الديناميكية الدينية، العلاقات بين المدينة والبيئة، و الهويات, والعنف والظواهر المتعلقة بالاتجار بالبشر والجريمة العابرة للحدود. كما يقوم بتنفيذ اعمال اثريه في نيجيريا واخرى للحفاظ على الارشيف العام والخاص. يمارس المعهد انشطته في نيجيريا وكذلك في بنين. وبوركينا فاسو والكاميرون وغامبيا وغانا وليبيريا، والنيجر، وتشاد وتوغو.

المعهد الفرنسي للبحث في افريقيا (IFRA) نيروبي (كينيا):
تأسس المعهد في نيروبي في العام ١٩٧٧حيث يعنى المعهد بدراسة الحياة السياسية المعاصرة والثقافة والمجتمع اضافه للديناميكيات الاقتصادية الإقليمية والعالمية لا سيما من زاوية النقد المعرفي. تغطي ابحاثه كل من كينيا، تنزانيا، واوغندا ورواندا وبوروندي وبشكل دوري على مناطق كيفو في جمهوريه الكنغو الديمقراطية.

بالإضافة للوحدة الفرنسية للأثار في السودان (SFDAS) تشكل هذه الوحدات البحثية الثلاثة (UMIFRE) وحدة البحث المشتركة (UAR ٣٣٣٦) – لأفريقيا وجنوب الصحراء.
مركزالدراسات والوثائق الاقتصادية والقانونية والاجتماعية (CEDEJ) مصر والسودان:
تم انشاء المركز (CEDEJ) بموجب اتفاقيه التعاون الفرنسية المصرية للعام ١٩٦٨ ويضم مركزا في القاهرة وفرعا في الخرطوم تركز ابحاثه على العلوم الإنسانية الرقمية ونظم المعلومات الجغرافية. مصر المعاصرة واعادة التشكيلات السياسية، الهجرة والتطورات السياسية والاجتماعية لشرق افريقيا.
لدى فرع المركز في السودان موقعا الكترونيا على منصة (Hypothèses) : https://cedejsudan.hypotheses.org/.

المركز الفرنسي للدراسات الأثيوبية (CFEE):
تم تأسيس المركز الفرنسي للدراسات الأثيوبية في العام ١٩٩١ ويجري المركز ابحاثا حول اثيوبيا واريتريا وارض الصومال وجيبوتي وجنوب السودان. تتركز اهتمامات المركز بشكل خاص حول البيئة والتبادلات والتقنيات منذ عصور ما قبل التاريخ. كما يبحث المركز في ثقافات الكتابة القديمة والتاريخ الشفوي وكذلك التحولات الاجتماعية والسياسية في القرن الافريقي حتى العصر الحديث والتراث في اثيوبيا والدراسات المتعلقة بالنوع الاجتماعي في المنطقة.
